Вязыке корень - вонь- обозначал не неприятный запах, а запах вообще. какими фактами современного языка можно это подтвердить?

Возьмём, например, слово "благовоние", что значит "приятный запах", "аромат". Слово составное: "благо" - от "благой", то есть "хороший", "приятный", "воние" - от "вонь", что означало просто "запах".