Организован в 2003 году на базе краеведческого музея города, который вел свою историю с 1989 года. Здесь хранятся и изучаются все коллекции музейного комплекса. В выставочных залах работают постоянные выставки: «Югорское наследие», «Природа реки Обь», «История судоходства на Оби». Периодически организовываются сменные фондовые экспозиции.
