Объяснить правописание окончаний глаголах в: сеет, грохочет, ворчит, рохочет, встряхивает.

ЛИЧНЫЕ окончания глаголов зависят от спряжения.
Т.е.: ставим глагол в инфинитив (нач.форма) сеять-1спр., значит в окончании пишем- сеЕШЬ, грохотать-1спр.-грохочЕШЬ, рокотать-1спр.-рокочЕТ, встряхивать-1спр.-встряхиваЕШЬ
ворчИШЬ, здесь 2спр. определяем по личному окончанию, т.к. оно ударное, ворчать-глагол 2спр.

Всё зависит от спряжения, в каждом спряжении разные окончании