Но главная её еда: полёвки и мыши. какая грамматическая основа?

О чем в предложении идет речь? О полёвках и мышах. 
Это однородные подлежащие.
Что о них говорится? Что они — еда.
Это сказуемое. 
Еда какая? Главная (определение).