Подскажите . как будет правильно гружённый углем вагон или гружёный углем вагон.

Гружённый - страдательное причастие. 
Если есть зависимое слово ( "углём"), то пишется "НН". 
Гружённый углём вагон - состав, который нагрузили углём. 

ГружеННый углем вагон. это отглагольное прилагательное. В них обычно пишется одна Н, но когда есть зависимое слово, то пишется НН. (жареная картошка, жаренная с грибами картошка)