Япомню руки матери моей, хотя её давно уж нет на свете. почему пишется запитая

Хоть - хотя. Это уступительный подчинительный союз, с которого связаны два простых предложения (две грамматические основы: 《я помню》 и 《нет на свете》(или же просто 《нет》)) в одно сложное предложение. Так на границе частей сложного предложения ставится запятая.

~Материал белорусской средней школы по русскому языку 9 класса...