Почему в предложении: "следующая дверь несла на себе краткую, но уже вовсе непонятную надпись: "перелыгино". (м.булгаков, "мастер и маргарита", 5 глава, 8 абзац). "не" со словом "непонятную" написано слитно? ведь если стоит слово "вовсе", то мы должны писать "не" раздельно со словом.

Это всё тонкости русского языка. Мы бы написали это слово раздельно, если бы было противопоставление и употреблен оборот "вовсе не". Так что дело в маленькой частичке "не" - она отсутствует, поэтому и пишем слитно.
Кстати, если бы было написано "вовсе не не понятную", то и смысл выражения был бы противоположный.