Стеклянный-хрустальный,гранёный-хрустальный-это антонимы?

Думаю, что синонимы. 

Нет, антоним-это слово, противоположное по значению.
Гранёный (то есть с гранями, стакан, например)- гладкий
хрусталь- это тоже род стекла, он не может быть антонимом.