Углаголов примириться-мириться и умирать-умереть одинаковые корни? если нет то почему?

Это разные корни. Потому что у них разное значение. 
Примириться - мириться корень -мир- (со знчением мир) 
Умирать -умереть корень с чередованием -мер-, -мир- (со значанием  застыть)