Является ли то, что только женщины могут забеременеть, стереотипом, учитывая то, что каждый человек определяет сам мужчина он или женщина, при этом не имея возможности отрицать прирожденный пол? (допустим, мой пол женский (наличие женских половых органов), но я мужчина)

Каждый человек в праве сам решать кем ему быть. Это не стереотипы, просто природой заложена лишь одна разновидность пола. А дальше свою судьбу мы уже выбираем саме. Женщиной мы хотим быть или мужчиной. 
Только сам факт того, что родить ребенка может только женский пол, уже давно опроверг мужчина, который выносил и родил ребенка без искуственных препаратов.