Существуют ли какие-нибудь реакции с хлорофиллом, которые бы изменили или растворили его , чтобы изменить цвет листа растения?

По идее, чтобы светиться ночью - надо излучать, а не отражать.

Для начала Вам думаю надо почитать про светящиеся морские бактериии.. Потом про методы генной инженерии - вектора (плазмиды, вирусы), рестриктазы, лигазы и т.п. А там и до генноинженерного цветочка не далеко.