Атом водорода - это, фактически и есть протон с одним электроном. Поскольку масса электрона ничтожно мала по сравнению с массой протона, то фактически масса атома водорода - это и есть масса протона. Вполне естественно, что массу всех других атомов решили сравнивать с массой самого маленького из них - массой атома водорода. Если строгое определение, то, да, там, насколько я помню, единица определяется именно как 1/12 массы атома углерода. Но, в принципе, для простоты можно считать, что а. е. м. (атомная единица массы) - это масса атома водорода, и относительная атомная масса выражены в этих единицах. А атомная масса - это просто масса атома, выраженная в обычных единицах массы, килограммах, например.
