Академия наук представляла собой единую систему с созданными при ней Академическим университетом и гимназией. Таким образом, Академия наук стала центром не только науки Российской империи, но и образования, являясь частью комплекса наряду с первым высшим светским учебным заведением и первым общеобразовательным средним учебным заведением в России.
