Все реки Кувандыкского района относятся к бассейну р. Урал. Их особенностью является крайне неравномерное распределение речного стока по сезонам года. В период весеннего таяния снега они сбрасывают до 80 % годового стока, тогда как за летний период — всего 12 %, а за осенне-зимний — 8 %.Река Урал — самая крупная транзитная река района. Из общей длины реки 2428 км на территорию области приходится 1164 км, на Кувандыкский район — около 80 км. Основными правыми притоками Урала на территории района являются Киндерля (Коноплянка), Аксакалка, Мечетка; левыми — Алимбет и Киялы-Буртя. Река Сакмара — крупнейший приток Урала, ее протяженность в районе составляет более 100 км. На территории района Сакмара и ее основные притоки (Бухарча, Куруил, Кайракла, Катрала, Кураганка) протекают по узким глубоким долинам с глубиной вреза до 250—300 м.
