Имеет ли право учитель ставить за четверть 3, если средний 4.0?

Если средне взвешенный 4.0, то нет.

Нет.Это говорит о том что учитель совершил грубейшую ошибку ,и вполне можно указать на такую оплошность со стороны учителя.