Можно ли поезд длиной 120м считать материальной точкой при определении его времени движения через мост длиной 300м? а при определении времени движения из алматы в астану?

Через мост длиной 300 м - нет, нельзя.
При определении движения из Алматы в Астану - да, можно (размер поезда намного меньше рассматриваемого расстояния).