Во-первых, хрящи, ещё остававшиеся в скелете черепа и конечностей амфибий, у рептилий заместились костями. Во-вторых, позвоночник чётко разделился на пять отделов. Шейный отдел состоит из нескольких позвонков, причём первые два обеспечивают поворот головы в любую сторону. В-третьих, поскольку ротовая полость больше не участвует в газообмене, челюсти стали вытянутыми, более пригодными для своей основной функции – захвата пищи.
