Селекция микроорганизмов имеет ряд специфических особенностей. У микроорганизмов, как правило, меньше генов, чем у животных и растений, более простыми являются механизмы регуляции генной активности. Кроме того, у селекционера имеется неограниченное количество материала для работы: за считанные дни на питательных средах можно вырастить миллиарды клеток. В селекции микроорганизмов широко применяется мутагенез, а поскольку большинство микроорганизмов гаплоидны, мутантные формы можно выявить уже в первом поколении. Кроме того, используется комбинирование генов путем конъюгации – обмена генетическим материалом между бактериальными клетками.
