Водные экосистемы населяют практически все типы беспозвоночных животных. В пресноводных реках и озёрах живут: пресноводный полип гидра и молочная планария, многие виды круглых червей, малощетинковые кольчатые черви и пиявки, брюхоногие и двустворчатые моллюски, а также большое количество разнообразных видов членистоногих. Обитателями водной среды являются представители ракообразных (речной рак, дафния), паукообразных и насекомых (жуки-плавунцы, личинки различных стрекоз и другие). Все эти животные в процессе эволюции выработали приспособления, позволившие им освоить водную среду обитания.
