Почему горные области на карте природных зон обозначены отдельно?

Потому что в горах природные зоны меняются по мере подъёма на высоту. Внизу, у подножия может быть лесная зона или степная, но поднимаясь всё выше и выше мы постепенно оказываемся в тундровой зоне, а потом и в ледяной, если горы достаточно высокие.