Дыхательная система водных животных представлена тонкостенными выростами кожи – жабрами. Вода входит в жаберные полости через щель между головогрудью и телом, а выходит через отверстие, расположенное около переднего конца борозды головогруди. Газообмен происходит в жабрах и клетках диффузно. Органы воздушного дыхания членистоногих – легочные мешки, сообщающиеся с внешней средой дыхательными щелями, и тончайшие дыхательные трубочки – трахеи, которые распределяют воздух во все органы.
