Т.к хламидомонада обитает в воде ей необходимо удаление жидкости, которая поступает в клетку. Содержание солей в водоеме, как правило, намного выше, чем в самой клетке. По законам физики, жидкость и поступает из области с большей концентрацией в меньшую. Т.е. в клетку водоросли. Сократительные вакуоли избавляют водоросль от излишка жидкости.
