Чем различаются рудиментарные органы и атавизмы; что у них

Атавизмы - случаи возвращения в отдельных особей к признакам предков.
Многососковость или густой волосяной покров, боковые пальцы у коней. Гены, которые отвечают за данный признак, ссохраняется в эволюции данного вида(это есть схожестью между атавизмами и рудиментами, что и те и другие сохраняются в эволюции).

Рудименты - органы, которые потеряли в процессе эволюции значение для сохранения вида и находятся в стадии исчезновения.