Прежде всего это морфологические различия.Связано это с тем,что особи одного и того же вида проживают в разных условиях,и в результате при адаптации изменяется морфология.К примеру возьмём человеческие популяции которые проживают в жарких и холодных условиях.Для людей,проживающих в жарких условиях,характерен тёмная пигментация кожи,жесткие волосы.А для людей в холодных и умеренных широтах характерен светлый оттенок кожи.Связано всё это с адаптацией к условиям в природе(естественный отбор).Изоляция популяции играет большую роль!Приведу ещё пример:породы собак.Они возникли в результате сознательной деятельности человека.Многие подроды совсем не похожи друг на друга.Тут уже действует искусственный отбор,селекция и т.д.
