Есть такая теория дрейфа генов, она гласит о том, что когда-то был один материк, который поделился на несколько материков, которые отличаются друг от друга - это обусловило различие флоры и фауны. Ну и в целом, я считаю, что отличия возникли в процессе эволюции, все зависит от того какие организмы обитают в тех или иных территориях, например, в тех местах где много радиолярий большое кол-во соли и минералов, а там где отсутствуют эти представители минералов и солей меньше.
