Почему нельзя считать морфологический критерий основным для черной и красной смородин?

Потому что и красная и черная смородины имеют почти одинаковое строение.
тип плода, тип листовой пластины, тип куста и т.п.
чтобы соотнести их к разным видам нужны дополнительные критерии, в частности генетический