Если бы исчезли все бактерии гниения, то

Прекратился бы процесс гниения и все завалило бы мусором. В земле исчез бы перегной и погибли бы все растения.

То мы жили бы в горах из мусора. А вообще то в процессе гниения биологический материал превращается в пищу для растительного мира.