В самостоятельное царство растения выделяют потому, что

Потому что они сочетают признаки как растений так и животных. Из-за этого их нельзя отнести ни к животным ни к растениям.

Традиционно грибы изучали в курсе ботаники потому, что они казались ближе к растениям, чем к животным. Но поняв что они могут сочетать качества растений и животных их решили выделить в отдельное царство - грибы.