В принципе оба, т.к. слово может употребляться в единственном числе как во множественном ( из этой же серии deer, fruit). Но если это единственное число и существительное исчисляемое, то должен быть артикль. Во втором предложении его нет и это ошибка. Поэтому только первый вариант: Fish live in the sea. (рыбы живут в воде).
Первое - если мн.ч
Второе - если ед.ч